De milieufunctionaris werkt in een team. De milieufunctionaris is verantwoordelijk voor zijn eigen takenpakket, alleen of in teamverband. Hij heeft een uitvoerende, coördinerende, adviserende en signalerende rol. Hij ontvangt in de meeste gevallen leiding van een teamleider, een projectleider of een milieuadviseur. Zelf stuurt hij soms een team van uitvoerenden op locatie aan. Het aantal (project)medewerkers dat hij aanstuurt, varieert van één tot tien. Hij werkt echter altijd onder directe aansturing en in overleg met zijn leidinggevende. De milieufunctionaris kan een handhavende taak hebben, bijvoorbeeld ten aanzien van vergunningen, maar hij heeft geen opsporingsbevoegdheid. Door het brede karakter van het beroep variëren zijn werkzaamheden van sanering, milieumetingen, monstername, rapportage, informatieverstrekking, tot advisering en ondersteuning aan opdrachtgevers (zowel particulieren en bedrijven als overheid).